MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Bacillus thuringiensis Bt407 plasmid BTB_7p

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018882	AGA	2	6	183	188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
2	NC_018882	TGAG	2	8	192	199	25 %	25 %	50 %	0 %	514403574
3	NC_018882	GA	3	6	205	210	50 %	0 %	50 %	0 %	514403574
4	NC_018882	AAAAAG	2	12	260	271	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	514403574
5	NC_018882	CAA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
6	NC_018882	GAA	2	6	383	388	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
7	NC_018882	AAGA	2	8	389	396	75 %	0 %	25 %	0 %	514403574
8	NC_018882	TTTCT	2	10	398	407	0 %	80 %	0 %	20 %	514403574
9	NC_018882	TAA	2	6	466	471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
10	NC_018882	TAA	2	6	478	483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403574
11	NC_018882	ATT	2	6	484	489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
12	NC_018882	TCA	2	6	564	569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403574
13	NC_018882	GAA	2	6	572	577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
14	NC_018882	AAC	2	6	584	589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403574
15	NC_018882	A	7	7	693	699	100 %	0 %	0 %	0 %	514403574
16	NC_018882	GAA	2	6	734	739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403574
17	NC_018882	TTTA	2	8	900	907	25 %	75 %	0 %	0 %	514403574
18	NC_018882	AATT	2	8	924	931	50 %	50 %	0 %	0 %	514403574
19	NC_018882	A	6	6	962	967	100 %	0 %	0 %	0 %	514403574
20	NC_018882	TAT	3	9	1016	1024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403574
21	NC_018882	TGAT	2	8	1119	1126	25 %	50 %	25 %	0 %	514403574
22	NC_018882	TTTA	2	8	2144	2151	25 %	75 %	0 %	0 %	514403575
23	NC_018882	TC	3	6	2186	2191	0 %	50 %	0 %	50 %	514403575
24	NC_018882	TTA	2	6	2226	2231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403575
25	NC_018882	AATA	2	8	2307	2314	75 %	25 %	0 %	0 %	514403575
26	NC_018882	TTTG	2	8	2322	2329	0 %	75 %	25 %	0 %	514403575
27	NC_018882	T	6	6	2341	2346	0 %	100 %	0 %	0 %	514403575
28	NC_018882	GTTA	2	8	2441	2448	25 %	50 %	25 %	0 %	514403576
29	NC_018882	AGT	2	6	2452	2457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
30	NC_018882	T	6	6	2467	2472	0 %	100 %	0 %	0 %	514403576
31	NC_018882	TAG	2	6	2522	2527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403576
32	NC_018882	GTT	2	6	2543	2548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403576
33	NC_018882	TTCT	2	8	2569	2576	0 %	75 %	0 %	25 %	514403576
34	NC_018882	T	6	6	2584	2589	0 %	100 %	0 %	0 %	514403576
35	NC_018882	T	7	7	2690	2696	0 %	100 %	0 %	0 %	514403576
36	NC_018882	TA	3	6	2702	2707	50 %	50 %	0 %	0 %	514403576
37	NC_018882	A	6	6	3066	3071	100 %	0 %	0 %	0 %	514403577
38	NC_018882	AGT	2	6	3076	3081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403577
39	NC_018882	AT	3	6	3268	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	514403577
40	NC_018882	AAT	2	6	3294	3299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403577
41	NC_018882	AAAG	2	8	4543	4550	75 %	0 %	25 %	0 %	514403578
42	NC_018882	ATT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403578
43	NC_018882	GAAC	2	8	4576	4583	50 %	0 %	25 %	25 %	514403578
44	NC_018882	AAAAG	2	10	4612	4621	80 %	0 %	20 %	0 %	514403578
45	NC_018882	ATTC	2	8	4635	4642	25 %	50 %	0 %	25 %	514403578
46	NC_018882	TGT	2	6	4695	4700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
47	NC_018882	TTG	2	6	4701	4706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403578
48	NC_018882	TGTT	2	8	4785	4792	0 %	75 %	25 %	0 %	514403578
49	NC_018882	T	6	6	4791	4796	0 %	100 %	0 %	0 %	514403578
50	NC_018882	GAGAA	2	10	4811	4820	60 %	0 %	40 %	0 %	514403578
51	NC_018882	TGA	2	6	4845	4850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
52	NC_018882	A	6	6	4850	4855	100 %	0 %	0 %	0 %	514403578
53	NC_018882	AAAAAC	2	12	4892	4903	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	514403578
54	NC_018882	T	6	6	4918	4923	0 %	100 %	0 %	0 %	514403578
55	NC_018882	GTG	2	6	5000	5005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	514403578
56	NC_018882	CAA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
57	NC_018882	AGAA	2	8	5090	5097	75 %	0 %	25 %	0 %	514403578
58	NC_018882	ATAG	2	8	5098	5105	50 %	25 %	25 %	0 %	514403578
59	NC_018882	AGA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
60	NC_018882	TCT	2	6	5248	5253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403578
61	NC_018882	AAGATT	2	12	5293	5304	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	514403578
62	NC_018882	GAT	2	6	5317	5322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
63	NC_018882	TA	3	6	5324	5329	50 %	50 %	0 %	0 %	514403578
64	NC_018882	T	6	6	5340	5345	0 %	100 %	0 %	0 %	514403578
65	NC_018882	AG	3	6	5371	5376	50 %	0 %	50 %	0 %	514403578
66	NC_018882	GAAG	2	8	5388	5395	50 %	0 %	50 %	0 %	514403578
67	NC_018882	TGA	3	9	5541	5549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403578
68	NC_018882	GAA	2	6	5593	5598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
69	NC_018882	CAA	2	6	5599	5604	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403578
70	NC_018882	GAA	2	6	5624	5629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	514403578
71	NC_018882	GA	3	6	5659	5664	50 %	0 %	50 %	0 %	514403578
72	NC_018882	ATT	2	6	5677	5682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	514403579
73	NC_018882	CAA	2	6	5687	5692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	514403579
74	NC_018882	AAT	2	6	5762	5767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
75	NC_018882	TGA	2	6	5815	5820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403579
76	NC_018882	ATGA	2	8	5873	5880	50 %	25 %	25 %	0 %	514403579
77	NC_018882	ATGA	2	8	5936	5943	50 %	25 %	25 %	0 %	514403579
78	NC_018882	TGT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403579
79	NC_018882	AAT	2	6	5976	5981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403579
80	NC_018882	TGA	2	6	6160	6165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403580
81	NC_018882	TTC	2	6	6190	6195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403580
82	NC_018882	CTA	2	6	6213	6218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	514403580
83	NC_018882	TTTG	2	8	6313	6320	0 %	75 %	25 %	0 %	514403580
84	NC_018882	AAT	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403580
85	NC_018882	TGTT	2	8	6409	6416	0 %	75 %	25 %	0 %	514403580
86	NC_018882	TAA	2	6	6439	6444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403580
87	NC_018882	TA	3	6	6529	6534	50 %	50 %	0 %	0 %	514403580
88	NC_018882	T	7	7	6679	6685	0 %	100 %	0 %	0 %	514403581
89	NC_018882	T	7	7	6689	6695	0 %	100 %	0 %	0 %	514403581
90	NC_018882	TTC	2	6	6713	6718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403581
91	NC_018882	AGT	2	6	6761	6766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	514403581
92	NC_018882	T	6	6	6829	6834	0 %	100 %	0 %	0 %	514403581
93	NC_018882	T	6	6	7265	7270	0 %	100 %	0 %	0 %	514403582
94	NC_018882	AT	3	6	7299	7304	50 %	50 %	0 %	0 %	514403582
95	NC_018882	GTT	2	6	7358	7363	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	514403582
96	NC_018882	GA	3	6	7397	7402	50 %	0 %	50 %	0 %	514403582
97	NC_018882	AAT	2	6	7407	7412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	514403582
98	NC_018882	A	6	6	7428	7433	100 %	0 %	0 %	0 %	514403582
99	NC_018882	T	7	7	7465	7471	0 %	100 %	0 %	0 %	514403582
100	NC_018882	TCT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	514403582
101	NC_018882	A	8	8	7590	7597	100 %	0 %	0 %	0 %	514403582
102	NC_018882	CGG	2	6	7611	7616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	514403582

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.